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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rsxA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: type iii effector hopa1; | PDBTitle: the structure of the effector protein from pseudomonas syringae pv.2 tomato strain dc3000 |
Added to library: Sat Mar 14 08:18:31 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | Q | A | A | Q | S | T | F | N | S | F | H | E | W | A | K | Q | A | E | A | M | R | N | P | S | R | M | D | I | Y | K | I | Y | K | Q | D | A | P | H | S | H | P | M | S | D | E | Q | Q | E | E | F | L | H | T | L | K | A | L | N | G | K | N | G | I | E | V | R | T | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | D | S | V | R | N | K | K | D | R | N | L | D | K | Y | I | A | E | S | P | D | A | K | R | F | F | Y | R | I | I | P | K | H | E | R | R | E | D | K | N | Q | G | R | L | T | I | G | V | Q | P | Q | Y | A | T | Q | L | T | R | A | M | A | T | L | I | G | K | E | S | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | H | G | K | V | I | G | P | A | C | H | G | Q | M | T | D | S | A | V | L | Y | I | N | G | D | V | A | K | A | E | K | L | G | E | K | L | K | Q | M | S | G | I | P | L | D | A | F | V | E | H | T | P | L | S | M | Q | S | L | S | K | G | L | S | Y | A | E | S | I | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | B | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | T | R | G | H | G | M | S | R | A | E | V | I | S | D | A | L | R | M | D | G | M | P | F | L | A | R | L | K | L | S | L | S | A | N | G | Y | D | P | D | N | P | A | L | R | N | T | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | B | S | S | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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