|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4rsjD_ | PDB header: cell cycle | Chain: D: PDB Molecule: chromosome partition protein smc; | PDBTitle: pyrococcus furiosus smc hinge domain with an extended coiled coil |
Added to library: Sat Jan 3 08:17:43 2015 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | V | V | E | D | K | R | A | E | I | S | E | I | E | G | K | L | S | T | I | Q | A | K | R | I | K | V | E | K | E | I | E | A | K | S | N | E | L | E | K | V | S | K | E | L | E | S | S | E | R | E | L | I | A | A | E | A | Q | R | E | V | R | G | N | R | A | A | E | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | S | G | I | G | G | I | Y | G | T | L | A | E | L | I | K | V | K | D | E | A | Y | A | L | A | I | E | V | A | L | G | N | R | A | D | N | V | V | V | E | D | E | L | V | A | E | K | A | I | K | Y | L | K | E | H | K | L | G | R | L | T | F | L | P | L | N | K | I | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | H | V | D | S | S | V | G | L | P | A | V | D | V | I | E | Y | D | Q | K | I | E | N | A | V | K | F | A | L | G | D | T | V | I | V | N | S | M | E | E | A | R | P | H | I | G | K | V | R | M | V | T | I | E | G | E | L | Y | E | R | S | G | A | I | T | G | G | H | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | B | T | T | B | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . |
Sequence | A | D | T | T | K | L | R | E | K | V | E | S | L | R | R | R | K | E | A | L | E | G | E | L | N | S | L | K | I | E | L | R | S | L | E | N | A | S | F | E | L | R | I | K | L | S | D | E | K | K | E | L | E | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|