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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rl8A_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like | PDBTitle: crystal structure of the cog4313 outer membrane channel from2 pseudomonas putida f1 |
Added to library: Sat Aug 1 08:19:25 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | V | D | P | G | D | Y | E | A | L | P | V | G | A | T | I | G | V | V | Y | Y | Q | H | S | T | T | D | S | A | Y | A | N | G | H | K | V | S | S | D | F | K | L | T | S | N | V | G | I | L | R | L | L | H | V | Y | Q | L | T | D | R | L | T | L | E | P | Q | F | L | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | G | R | V | S | S | S | G | D | A | S | A | L | G | D | T | S | G | V | G | D | L | T | L | T | A | P | L | K | Y | R | L | N | E | A | N | D | I | L | G | A | T | V | Y | L | T | A | P | T | G | N | Y | N | R | D | D | A | L | N | L | G | E | N | R | W | K | V | D | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | A | Y | V | K | H | L | G | E | K | W | A | V | D | L | V | G | D | A | I | W | Y | S | D | N | D | D | F | G | S | S | S | A | R | R | E | Q | D | V | S | Y | G | A | Q | L | M | G | R | Y | I | V | D | P | G | T | S | L | A | I | G | L | G | H | T | W | G | G | E | N | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | I | D | G | T | A | Q | D | D | R | A | E | T | T | N | F | R | V | T | A | N | K | F | F | T | A | K | D | Q | L | Q | M | Q | L | G | R | D | L | A | V | E | N | G | P | K | E | N | F | R | L | N | L | R | Y | V | R | V | F | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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