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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rkqD_ | PDB header: transcription regulator | Chain: D: PDB Molecule: transcriptional regulator, laci family; | PDBTitle: crystal structure of laci family transcriptional regulator from2 arthrobacter sp. fb24, target nysgxrc-11027r |
Added to library: Sat Nov 15 08:58:27 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | T | S | V | G | L | A | I | P | D | L | T | N | P | Y | F | P | A | F | A | S | S | V | V | E | L | A | T | L | R | G | W | H | V | V | V | D | D | Y | G | H | G | G | R | S | G | L | D | A | V | E | H | L | A | P | Q | V | D | A | V | I | G | Y | L | G | G | Y | A | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | Q | T | V | L | G | R | R | P | L | I | V | L | D | E | N | P | G | G | A | A | G | S | I | N | F | D | Y | Q | H | A | A | K | V | A | V | A | Q | L | M | D | S | K | R | Q | H | I | A | Y | L | E | A | G | S | A | S | E | S | D | E | P | V | P | C | T | V | R | G | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | G | G | G | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | A | G | R | L | D | E | L | G | A | S | W | S | L | I | V | A | E | E | T | A | E | A | A | R | E | A | A | A | A | F | L | R | E | H | P | E | T | D | G | I | L | A | F | N | D | L | M | A | A | G | V | L | K | A | L | S | G | S | G | R | R | V | P | E | D | C | A | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | G | M | D | G | I | P | L | G | E | L | L | S | P | Q | L | S | T | M | A | L | D | L | R | E | V | G | R | A | A | V | E | L | L | V | G | L | L | S | G | A | V | T | P | G | S | Q | S | S | R | T | T | L | K | H | R | L | V | L | R | E | S | T | E | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | T | S | S | S | T | S | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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