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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rk6B_ | PDB header: transcription regulator | Chain: B: PDB Molecule: glucose-resistance amylase regulator; | PDBTitle: crystal structure of laci family transcriptional regulator ccpa from2 weissella paramesenteroides, target efi-512926, with bound glucose |
Added to library: Sat Nov 1 08:53:36 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | V | V | G | V | V | V | P | L | I | H | T | N | F | A | D | E | I | I | K | G | L | Y | E | T | T | I | S | S | G | Y | E | L | L | I | T | Y | L | D | E | D | E | D | H | Q | Y | Q | V | F | Q | T | L | L | S | R | Q | V | G | A | V | F | X | L | S | L | D | I | P | S | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | X | I | D | K | L | L | E | E | Q | I | S | V | I | S | L | T | A | L | L | S | E | Q | I | S | A | V | T | S | N | E | F | E | X | X | N | S | I | V | D | Y | L | I | D | X | G | H | K | N | I | A | L | V | G | D | T | K | L | T | T | N | I | S | S | T | R | R | T | N | F | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | S | X | T | D | H | N | L | A | Y | E | N | I | F | L | Y | G | N | D | H | S | Y | E | T | G | Y | T | S | V | T | T | G | Y | D | I | N | Q | L | P | F | T | A | A | I | A | T | A | D | X | V | G | Q | G | L | I | N | A | X | S | D | H | G | K | T | V | P | E | D | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | B | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | I | V | T | I | D | G | L | Q | Q | T | E | I | A | R | P | K | L | T | T | V | K | Q | D | F | P | E | I | G | R | I | A | X | Q | L | F | L | D | S | P | Q | I | I | Y | I | P | T | E | L | I | Q | R | D | S | V | L | N | L | N | S | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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