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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rj9A_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: c2 domain-containing protein-like; | PDBTitle: structure of a plant specific c2 domain protein, osgap1 from rice |
Added to library: Sat Aug 29 08:24:57 2015 | |
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Sequence | L | V | G | L | V | K | V | R | V | V | R | G | V | N | L | A | V | R | D | L | R | S | S | D | P | Y | V | I | V | R | M | G | K | Q | K | L | K | T | R | V | I | K | K | T | T | N | P | E | W | N | D | E | L | T | L | S | I | E | D | P | A | V | P | V | R | L | E | V | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | D | T | F | I | D | D | A | M | G | N | A | E | L | D | I | R | P | L | V | E | V | V | K | M | K | I | E | G | V | A | D | N | T | V | V | K | K | V | V | P | N | R | Q | N | C | L | A | E | E | S | T | I | Y | I | S | E | G | K | V | K | Q | D | V | V | L | R | L | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | B | S | S | T | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | E | C | G | E | I | E | L | Q | L | Q | W | V | D | I | P | G | S | K | G | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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