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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rgwA_ | PDB header: transferase/transcription | Chain: A: PDB Molecule: transcription initiation factor tfiid subunit 1; | PDBTitle: crystal structure of a taf1-taf7 complex in human transcription factor2 iid |
Added to library: Sat Dec 6 08:19:53 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | I | Q | H | S | I | P | A | V | E | L | R | Q | P | F | F | P | T | H | M | G | P | I | K | L | R | Q | F | H | R | P | P | L | K | K | Y | S | F | G | A | L | S | Q | P | G | P | H | S | V | Q | P | L | L | K | H | I | K | K | K | A | K | M | R | E | Q | E | R | Q | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | G | G | E | M | F | F | M | R | T | P | Q | D | L | T | G | K | D | G | D | L | I | L | A | E | Y | S | E | E | N | G | P | L | M | M | Q | V | G | M | A | T | K | I | K | N | Y | Y | K | R | K | P | G | K | D | P | G | A | P | D | C | K | Y | G | E | T | V | Y | C | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | P | F | L | G | S | L | H | P | G | Q | L | L | Q | A | F | E | N | N | L | F | R | A | P | I | Y | L | H | K | M | P | E | T | D | F | L | I | I | R | T | R | Q | G | Y | Y | I | R | E | L | V | D | I | F | V | V | G | Q | Q | C | P | L | F | E | V | P | G | P | N | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | A | N | T | H | I | R | D | F | L | Q | V | F | I | Y | R | L | F | W | K | S | K | D | R | P | R | R | I | R | M | E | D | I | K | K | A | F | P | S | H | S | E | S | S | I | R | K | R | L | K | L | C | A | D | F | K | R | T | G | M | D | S | N | W | W | V | L | K | S | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | F | R | L | P | T | E | E | E | I | R | A | M | V | S | P | E | Q | C | C | A | Y | Y | S | M | I | A | A | E | Q | R | L | K | D | A | G | Y | G | E | K | S | F | K | I | D | D | E | V | R | T | A | P | W | N | T | T | R | A | F | I | A | A | M | K | G | K | C | L | L | E | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | ||||
Sequence | T | G | V | A | D | P | T | G | C | G | E | G | F | S | Y | V | K | I | P | N | K | S | V | A | E | H | Q | E | R | Y | K | E | E | C | Q | R | I | F | D | L | Q | N | K | V | L | S | S | T | E | V | L | D | T | D | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S |
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