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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rgpA_ | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: csm6_iii-a; | PDBTitle: crystal structure of uncharacterized crispr/cas system-associated2 protein csm6 from streptococcus mutans |
Added to library: Sat Dec 27 08:15:39 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | A | T | E | Q | E | T | L | T | I | L | L | D | V | Y | A | Y | Y | Q | A | Y | Q | I | V | K | A | S | Q | F | F | S | D | D | I | I | F | L | L | E | L | L | K | E | R | R | E | L | N | V | D | F | L | F | Q | N | Q | V | H | L | Q | E | L | E | L | T | Y | H | I | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | D | N | A | Y | E | E | E | L | L | A | N | Y | I | X | D | L | E | A | K | L | R | N | D | H | I | I | D | F | V | R | S | V | S | P | I | L | Y | R | L | L | X | R | L | X | Q | S | Q | V | A | D | I | N | D | Y | I | Y | D | A | K | N | D | Q | Y | D | T | W | K | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | X | H | D | S | A | N | P | F | V | Q | N | F | V | A | K | G | R | D | S | K | I | T | S | R | S | L | A | D | F | I | Q | L | T | D | L | P | Q | A | I | K | D | N | I | L | L | L | R | D | F | E | K | S | V | R | N | P | L | A | H | L | I | K | P | F | D | E | E | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | B | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | H | R | T | T | G | F | S | S | Q | T | F | L | E | K | I | I | Q | L | A | V | F | S | G | I | H | Y | D | N | D | K | F | Y | F | D | K | V | N | E | L | I | K | R | I | Y | Q | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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