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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rfti_ | PDB header: virus | Chain: I: PDB Molecule: coat protein; | PDBTitle: t=1 subviral particle of grouper nervous necrosis virus capsid protein2 deletion mutant (delta 1-34 & 218-338) |
Added to library: Sat Oct 10 08:14:38 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | N | D | V | H | L | S | G | M | S | R | I | S | Q | A | V | L | P | A | G | T | G | T | D | G | Y | V | V | V | D | A | T | I | V | P | D | L | L | P | R | L | G | H | A | A | R | I | F | Q | R | Y | A | V | E | T | L | E | F | E | I | Q | P | M | C | P | A | N | T | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | Y | V | A | G | F | L | P | D | P | T | D | N | D | H | T | F | D | A | L | Q | A | T | R | G | A | V | V | A | K | W | W | E | S | R | T | V | R | P | Q | Y | T | R | T | L | L | W | T | S | S | G | K | E | Q | R | L | T | S | P | G | R | L | I | L | L | C | V | G | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | S | T | T | S | S | B | S | S | S | S | G | G | G | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | D | V | V | N | V | S | V | L | C | R | W | S | V | R | L | S | V | P | S | L | E | N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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