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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rflB_ | PDB header: oxidoreductase | Chain: B: PDB Molecule: glycerol-1-phosphate dehydrogenase [nad(p)+]; | PDBTitle: crystal structure of g1pdh with nadph from methanocaldococcus2 jannaschii |
Added to library: Sat Jul 25 08:28:08 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | I | V | T | P | R | Y | T | I | I | E | D | G | A | I | N | K | I | E | E | I | L | K | K | L | N | L | K | N | P | L | V | I | T | G | K | N | T | K | K | Y | C | R | F | F | Y | D | I | V | Y | Y | D | E | I | L | N | N | L | E | L | K | K | Y | T | A | Y | D | C | V | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | I | G | G | G | R | S | I | D | T | G | K | Y | L | A | Y | K | L | G | I | P | F | I | S | V | P | T | T | A | S | N | D | G | I | A | S | P | I | V | S | I | R | Q | P | S | F | M | V | D | A | P | I | A | I | I | A | D | T | E | I | I | K | K | S | P | R | R | L | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | G | M | G | D | I | V | S | N | I | T | A | V | L | D | W | K | L | A | Y | K | E | K | G | E | K | Y | S | E | S | S | A | I | F | S | K | T | I | A | K | E | L | I | S | Y | V | L | N | S | D | L | S | E | Y | H | N | K | L | V | K | A | L | V | G | S | G | I | A | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | A | N | S | S | R | P | A | S | G | S | E | H | L | F | S | H | A | L | D | K | L | K | E | E | Y | N | L | N | I | N | S | L | H | G | E | Q | C | G | I | G | T | I | M | M | S | Y | L | H | E | K | E | N | K | K | L | S | G | L | H | E | K | I | K | M | S | L | K | K | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | ||
Sequence | D | A | P | T | T | A | K | E | L | G | F | D | E | D | I | I | I | E | A | L | T | M | A | H | K | I | R | N | R | W | T | I | L | R | D | G | L | S | R | E | E | A | R | K | L | A | E | E | T | G | V | I | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T |
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