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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rcwB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: slit and ntrk-like protein 1; | PDBTitle: crystal structure of human slitrk1 |
Added to library: Sat Nov 22 08:48:21 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | G | C | S | C | D | H | I | P | G | S | G | L | K | M | N | C | N | N | R | N | V | S | S | L | A | D | S | N | V | Q | E | L | F | L | R | D | N | K | I | H | S | I | R | K | S | H | F | V | D | Y | K | N | L | I | L | L | D | L | G | N | N | N | I | A | T | V | E | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | F | K | N | L | L | D | L | R | W | L | Y | M | D | S | N | Y | L | D | T | L | S | R | E | K | F | A | G | L | Q | N | L | E | Y | L | N | V | E | Y | N | A | I | Q | L | I | L | P | G | T | F | N | A | M | P | K | L | R | I | L | I | L | N | N | N | L | L | R | S | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | S | T | G | G | G | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | D | V | F | A | G | V | S | L | S | K | L | S | L | H | N | N | Y | F | M | Y | L | P | V | A | G | V | L | D | Q | L | T | S | I | I | Q | I | D | L | H | G | N | P | W | E | C | S | C | T | I | V | P | F | K | Q | W | A | E | R | L | G | S | E | V | L | M | S | D | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | B | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | C | E | T | P | V | N | F | F | R | K | D | F | M | L | L | S | N | D | E | I | C | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | B | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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