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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4rciC_ | PDB header: rna binding protein | Chain: C: PDB Molecule: yth domain-containing family protein 1; | PDBTitle: crystal structure of ythdf1 yth domain |
Added to library: Sat Oct 4 08:19:28 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | H | P | V | L | E | K | L | K | A | A | H | S | Y | N | P | K | E | F | E | W | N | L | K | S | G | R | V | F | I | I | K | S | Y | S | E | D | D | I | H | R | S | I | K | Y | S | I | W | C | S | T | E | H | G | N | K | R | L | D | S | A | F | R | C | M | S | K | G | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | L | L | F | S | V | N | G | S | G | H | F | C | G | V | A | E | M | K | S | P | V | D | Y | D | K | W | K | G | K | F | D | V | Q | W | I | F | V | K | D | V | P | N | N | Q | L | R | H | I | R | L | E | N | N | D | N | K | P | V | T | N | S | R | D | T | Q | E | V | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | B | S | S | B | G | G | G | T | T | T | G | G | G | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . |
Sequence | E | K | A | K | Q | V | L | K | I | I | S | S | Y | K | H | T | T | S | I | F | D | D | F | A | H | Y | E | K | R | Q | E | E | E | E | V | V | R | K | E | R | Q | S | R | N | K | |||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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