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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4r8pL_ | PDB header: structural protein/dna | Chain: L: PDB Molecule: e3 ubiquitin-protein ligase ring2, ubiquitin-conjugating | PDBTitle: crystal structure of the ring1b/bmi1/ubch5c prc1 ubiquitylation module2 bound to the nucleosome core particle |
Added to library: Sat Nov 8 09:14:52 2014 | |
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Sequence | K | T | W | E | L | S | L | Y | E | L | Q | R | T | P | Q | E | A | I | T | D | G | L | E | I | V | V | S | P | R | S | L | H | S | E | L | M | C | P | I | C | L | D | M | L | K | N | T | M | T | T | K | E | C | L | H | R | F | C | A | D | C | I | I | T | A | L | R | S | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | B | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | E | C | P | T | C | R | K | K | L | V | S | K | R | S | L | R | P | D | P | N | F | D | A | L | I | S | K | I | Y | P | S | G | S | G | S | R | S | A | L | K | R | I | N | K | E | L | S | D | L | A | R | D | P | P | A | Q | C | S | A | G | P | V | G | D | D | M | F | H | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | T | B | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | A | T | I | M | G | P | N | D | S | P | Y | Q | G | G | V | F | F | L | T | I | H | F | P | T | D | Y | P | F | K | P | P | K | V | A | F | T | T | R | I | Y | H | P | N | I | N | S | N | G | S | I | C | L | D | I | L | R | S | Q | W | S | P | A | L | T | I | S | K | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S | S | B | B | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . |
Sequence | L | S | I | C | S | L | L | C | D | P | N | P | D | D | P | L | V | P | E | I | A | R | I | Y | K | T | D | R | D | K | Y | N | R | I | S | R | E | W | T | Q | K | Y | A | M | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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