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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4r5cA_ | PDB header: de novo protein | Chain: A: PDB Molecule: leucine rich repeat protein; | PDBTitle: crystal structure of computational designed leucine rich repeats2 dlrr_e in space group of p212121 |
Added to library: Sat Jan 10 08:39:32 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | I | T | V | S | T | P | I | K | Q | I | F | P | D | D | A | F | A | E | T | I | K | A | N | L | K | K | K | S | V | T | D | A | V | T | Q | N | E | L | N | S | I | D | Q | I | I | A | N | N | S | D | I | K | S | V | Q | G | I | Q | Y | L | P | N | V | R | Y | L | A | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | N | K | L | H | D | I | S | A | L | K | E | L | T | N | L | G | W | L | N | L | S | N | N | Q | L | E | T | L | P | Q | G | V | F | E | K | L | T | N | L | T | T | L | N | L | S | N | N | Q | L | T | S | L | P | Q | G | V | F | E | R | L | A | S | L | T | T | L | N | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | N | Q | L | T | S | L | P | Q | G | V | F | E | R | L | T | N | L | T | T | L | N | L | S | N | N | Q | L | T | S | L | P | Q | G | V | F | E | R | L | T | N | L | T | T | L | N | L | S | N | N | Q | L | T | S | L | P | Q | G | V | F | E | R | L | T | S | L | H | T | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | S | N | N | G | I | T | D | I | S | A | L | K | N | L | D | N | L | H | T | L | D | L | S | N | N | G | I | T | D | I | S | A | L | K | N | L | D | N | L | H | T | L | D | L | S | N | N | G | I | T | D | I | S | A | L | K | N | L | T | S | L | H | T | L | D | L | S | N | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | G | I | T | D | I | S | A | L | K | N | L | D | N | L | E | T | L | D | L | R | N | N | G | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | S | S | S |
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