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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4qpvB_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (sav1486) from2 staphylococcus aureus subsp. aureus mu50 at 1.80 a resolution |
Added to library: Sat Aug 23 08:14:27 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | V | P | E | E | X | E | A | S | K | Y | V | G | Q | G | F | Q | P | P | A | E | K | D | A | I | E | F | S | K | K | H | K | D | K | I | A | K | R | G | E | Q | F | F | X | D | N | F | G | L | K | V | K | A | T | N | V | V | G | S | G | D | G | V | E | V | F | V | H | C | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | S | T | T | S | B | T | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | H | D | I | V | F | N | A | S | I | P | F | D | K | S | I | I | E | S | D | S | S | L | R | S | E | D | K | G | D | D | X | S | T | L | V | G | T | V | L | S | G | F | E | Y | R | A | H | K | E | E | L | D | N | L | T | E | V | L | K | E | Y | K | S | K | Y | K | Y | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | T | E | N | A | I | X | K | T | Q | N | S | G | F | R | N | E | Y | Y | Y | L | T | A | I | P | Y | T | L | D | E | Y | K | R | Y | F | Q | P | L | I | K | E | D | D | K | S | F | R | D | G | X | R | N | S | K | K | Q | L | K | D | K | S | R | P | Y | V | V | T | T | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | B | S | S | T | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . |
Sequence | S | T | K | D | N | F | T | K | D | N | T | I | D | E | X | I | D | F | S | E | V | L | K | K | K | K | N | I | P | H | D | L | N | V | S | L | Q | I | S | N | K | Y | I | N | T | K | R | P | N | Y | S | K | K | E | V | I | E | V | G | V | F | N | H | E | ||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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