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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c4qnuH_ | PDB header: transferase | Chain: H: PDB Molecule: trna (mo5u34)-methyltransferase; | PDBTitle: crystal structure of cmob bound with cx-sam in p21212 | 
| Added to library: Sat Sep 20 08:35:10 2014 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | M | I | D | F | G | N | F | Y | S | L | I | A | K | N | H | L | S | H | W | L | E | T | L | P | A | Q | I | A | N | W | Q | R | E | Q | L | F | K | Q | W | S | N | A | V | E | F | L | P | E | I | K | P | Y | R | L | D | L | L | H | S | V | T | A | E | S | E | E | P | L | S | A | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S | T | T | G | G | G | G | G | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S | S |  |  |  | S | S | S |  |  |  | S | S |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | G | Q | I | K | R | I | E | T | L | M | R | N | L | M | P | W | R | K | G | P | F | S | L | Y | G | V | N | I | D | T | E | W | R | S | D | W | K | W | D | R | V | L | P | H | L | S | D | L | T | G | R | T | I | L | D | V | G | C | G | S | G | Y | H | M | W | R | M | I | G | A | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G | S | T | T |  |  |  |  |  | T | T | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | G | A | H | L | A | V | G | I | D | P | T | Q | L | F | L | C | Q | F | E | A | V | R | K | L | L | G | N | D | Q | R | A | H | L | L | P | L | G | I | E | Q | L | P | A | L | K | A | F | D | T | V | F | S | M | G | V | L | Y | H | R | R | S | P | L | E | H | L | W | Q | L | K | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | S | S |  |  |  |  | G | G | G |  |  |  |  |  |  |  | S | G | G | G | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 | 
| Sequence | D | Q | L | V | N | E | G | E | L | V | L | E | T | L | V | I | D | G | D | E | N | T | V | L | V | P | G | D | R | Y | A | Q | M | R | N | V | Y | F | I | P | S | A | L | A | L | K | N | W | L | K | K | C | G | F | V | D | I | R | I | A | D | V | S | V | T | T | T | E | E | Q | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | B | S | T | T |  |  | S | B | T | T | B | S | S |  |  | B |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | 
| Sequence | R | R | T | E | W | M | V | T | E | S | L | A | D | F | L | D | P | H | D | P | G | K | T | V | E | G | Y | P | A | P | K | R | A | V | L | I | A | R | K | P | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | S |  |  |  |  |  |  | T | T |  |  |  |  |  | T | T | S | S | B |  |  |  |  |  |  |  |  | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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