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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4qmhA_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: lp04448p; | PDBTitle: the xmap215 family drives microtubule polymerization using a2 structurally diverse tog array |
Added to library: Sat Jul 12 08:18:52 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | D | L | L | P | R | V | D | I | A | P | Q | I | T | E | A | L | L | K | E | M | S | D | K | D | W | K | T | R | N | E | G | L | T | K | L | Q | A | I | I | S | E | A | R | L | I | K | P | S | I | G | D | L | A | P | A | L | A | H | R | L | V | D | S | N | A | K | I | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | G | G | G | S | T | S | S | S | B | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | L | A | I | C | E | Q | L | A | T | A | M | G | A | G | C | R | N | H | V | R | N | L | F | P | G | F | L | H | A | L | G | D | N | K | S | F | V | R | A | A | A | L | N | C | I | N | S | F | G | E | K | G | G | Y | K | E | F | F | E | S | E | M | I | A | D | A | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | T | T | S | S | S | G | G | G | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | G | S | P | A | L | K | T | E | L | W | A | W | L | A | D | K | L | P | G | L | P | P | K | S | V | S | K | E | D | I | H | S | M | V | P | H | L | Y | A | H | I | C | D | R | N | A | D | V | R | K | N | A | N | E | A | V | L | G | I | M | I | H | L | G | F | D | A | M | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | A | L | D | K | Q | K | P | A | S | K | K | D | I | L | A | A | L | E | K | A | R | P | N | L | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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