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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4qb7A_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (bvu_2522) from2 bacteroides vulgatus atcc 8482 at 2.55 a resolution (psi community3 target, nakayama) |
Added to library: Sat Jul 5 08:23:19 2014 | |
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Sequence | N | R | T | I | G | L | D | V | Y | T | E | V | E | T | T | T | S | T | L | K | A | N | A | G | F | G | I | F | A | Y | Q | T | S | S | A | G | W | N | S | E | K | G | N | T | T | P | N | F | X | Y | N | E | H | A | T | W | T | S | D | S | W | G | Y | T | N | L | R | F | W | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | D | D | K | K | I | T | F | F | A | Y | A | P | Y | E | S | K | P | E | V | G | T | D | Q | K | I | T | L | S | G | Q | N | A | K | G | A | P | T | I | T | F | E | V | K | T | S | N | N | W | K | D | X | I | D | L | V | T | D | C | H | T | A | I | Q | D | Q | T | N | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | K | G | T | V | Q | F | K | F | S | H | V | L | T | Q | I | A | N | I | K | V | K | P | D | V | N | L | G | T | D | T | K | I | F | V | T | G | L | K | L | D | P | G | S | T | T | L | Y | N | K | A | V | Y | K | F | D | N | D | T | W | E | A | I | S | P | D | A | S | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | T | E | Q | D | L | S | D | F | L | N | K | T | T | T | D | Q | W | G | Y | N | K | S | S | I | N | V | S | D | D | Q | N | A | T | A | L | F | S | D | T | E | A | L | Y | F | I | P | V | N | N | K | N | G | T | T | N | A | G | D | L | K | L | K | I | N | Y | D | I | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | B | B | T | T | B | S | B | S | S | S | S | S | T | T | S | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . |
Sequence | K | V | T | D | T | S | N | L | T | S | T | I | T | N | K | E | V | S | L | P | K | N | T | F | K | K | G | T | K | H | T | Y | V | L | T | I | K | X | N | A | I | K | I | T | V | E | D | N | X | E | G | W | T | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S |
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