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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4qanA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: hypothetical protein; | PDBTitle: crystal structure of a hypothetical protein (rumgna_02398) from2 ruminococcus gnavus atcc 29149 at 2.10 a resolution |
Added to library: Sat Jul 26 08:15:54 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | K | K | E | E | S | E | V | L | N | V | T | E | S | L | Q | K | E | S | E | I | T | S | F | S | E | E | E | E | A | V | L | Y | X | L | S | A | L | K | K | N | D | L | D | X | A | L | R | G | C | A | I | D | E | T | A | L | Q | I | N | F | V | K | T | A | E | E | L | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | X | Q | L | I | D | L | P | A | P | T | S | D | Y | S | Y | Y | F | P | L | T | S | A | E | X | T | K | A | Y | I | E | Q | F | E | E | L | S | T | E | I | P | E | I | E | T | L | E | V | L | E | I | A | E | K | K | E | K | E | R | E | E | Q | L | A | E | C | L | A | A | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | G | G | G | S | T | T | T | G | G | G | S | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | S | E | L | E | I | Y | V | K | C | G | E | Q | S | Y | R | L | G | F | T | A | V | Q | Y | E | K | N | W | K | I | H | S | L | K | E | G | L | L | Y | E | T | D | I | P | A | C | V | Q | X | E | E | X | R | E | A | K | K | T | Y | V | L | P | N | Q | L | T | G | A | N | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | Q | A | X | P | I | S | E | K | T | P | Q | R | A | V | E | Q | F | I | Y | A | I | E | K | G | D | L | T | R | A | L | A | F | A | T | T | E | S | S | Q | D | T | S | P | E | L | L | K | K | Q | G | E | Y | A | K | E | L | K | T | X | L | Y | G | F | L | G | T | E | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | R | L | Y | G | K | S | E | E | Q | L | N | K | L | R | G | K | L | N | P | E | Y | X | V | Y | L | D | L | I | K | V | I | P | I | E | T | E | E | N | T | E | T | V | K | Q | Y | A | G | L | Y | S | Y | N | G | K | N | Y | L | T | G | Y | T | L | C | R | Q | E | D | G | W | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | T | G | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | I | Q | S | L | S | A | P | A | L | S | L | E | S | G | E | V | X | R | L | S | K | E | E | S | R | K | T | S | E | Q | S | V | L | K | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | G | G | G | T | B | T | T | T | S |
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