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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4q9uE_ | PDB header: endocytosis | Chain: E: PDB Molecule: rab5 gdp/gtp exchange factor; | PDBTitle: crystal structure of the rab5, rabex-5delta and rabaptin-5c21 complex |
Added to library: Sat Jul 26 08:20:22 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | T | D | R | V | S | K | E | F | I | E | F | L | K | T | F | H | K | T | G | Q | E | I | Y | K | Q | T | K | L | F | L | E | G | M | H | Y | K | R | D | L | S | I | E | E | Q | S | E | C | A | Q | D | F | Y | H | N | V | A | E | R | M | Q | T | R | G | K | V | P | P | E | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | E | K | I | M | D | Q | I | E | K | Y | I | M | T | R | L | Y | K | Y | V | F | C | P | E | T | T | D | D | E | K | K | D | L | A | I | Q | K | R | I | R | A | L | R | W | V | T | P | Q | M | L | C | V | P | V | N | E | D | I | P | E | V | S | D | M | V | V | K | A | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | I | I | E | M | D | S | K | R | V | P | R | D | K | L | A | C | I | T | K | C | S | K | H | I | F | N | A | I | K | I | T | K | N | E | P | T | L | I | Y | I | V | L | K | G | N | P | P | R | L | Q | S | N | I | Q | Y | I | T | R | F | C | N | P | S | R | L | M | T | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | G | Y | Y | F | T | N | L | C | C | A | V | A | F | I | E | K | L | D | A | Q | S | L | N | L | S | Q | E | D | F | D | R | Y | M | S | G | Q | T | S | P | R | K | Q | M | Y | K | N | L | D | L | L | S | Q | L | N | E | R | Q | E | R | I | M | N | E | A | K | K | L | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | L | I | D | W | T | D | G | I | A | R | E | V | Q | D | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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