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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pn1B_ | PDB header: hydrolase/transcription regulator | Chain: B: PDB Molecule: mrna-capping enzyme subunit beta; | PDBTitle: structure of s. pombe pct1 rna triphosphatase in complex with the spt52 ctd |
Added to library: Sat Nov 15 08:15:01 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | A | V | P | K | I | E | M | N | F | L | N | K | P | I | V | P | D | T | T | K | V | I | S | N | F | L | T | H | Y | L | I | T | E | P | V | E | H | V | E | I | E | A | K | L | G | T | L | I | D | L | E | T | Q | N | R | F | E | F | P | V | M | N | E | T | I | L | N | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | N | L | R | T | R | F | E | S | D | M | T | A | S | E | H | K | Y | L | N | E | F | L | N | Q | A | F | R | D | S | Q | K | P | G | R | L | P | F | A | Y | K | H | T | K | Q | V | D | L | F | Y | E | T | E | D | K | I | R | V | S | K | N | Q | S | D | N | Q | V | L | A | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | S | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | K | K | R | R | V | A | D | L | F | L | Y | C | P | N | D | A | F | D | I | R | I | S | I | S | D | E | L | P | V | S | M | P | S | G | N | Q | Q | P | S | L | T | R | L | K | D | R | V | G | Y | V | H | Q | E | I | K | I | D | L | T | K | T | T | Q | N | D | P | V | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | |||||
Sequence | T | T | E | R | H | E | L | E | V | E | F | G | N | I | A | D | L | R | D | R | A | Q | K | A | K | D | G | M | E | A | P | L | F | R | R | V | Q | L | F | M | D | N | V | R | I | L | R | R | E | H | S | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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