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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ploB_ | PDB header: protein binding | Chain: B: PDB Molecule: netrin receptor dcc; | PDBTitle: crystal structure of chicken netrin-1 (ln-le3) in complex with mouse2 dcc (fn4-5) |
Added to library: Sat Jun 21 09:09:16 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | D | E | S | Q | V | P | D | Q | P | S | S | L | H | V | R | P | Q | T | N | C | I | I | M | S | W | T | P | P | L | N | P | N | I | V | V | R | G | Y | I | I | G | Y | G | V | G | S | P | Y | A | E | T | V | R | V | D | S | K | Q | R | Y | Y | S | I | E | R | L | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | S | H | Y | V | I | S | L | K | A | F | N | N | A | G | E | G | V | P | L | Y | E | S | A | T | T | R | S | I | T | D | V | S | T | P | M | L | P | P | V | G | V | Q | A | V | A | L | T | H | E | A | V | R | V | S | W | A | D | N | S | V | R | L | Y | T | V | R | W | R | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | |||||||||
Sequence | S | S | A | K | Y | K | S | E | D | T | T | S | L | S | Y | T | A | T | G | L | K | P | N | T | M | Y | E | F | S | V | M | V | T | K | N | R | R | S | S | T | W | S | M | T | A | H | A | T | T | Y | E | A | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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