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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pkmA_ | PDB header: toxin | Chain: A: PDB Molecule: cry51aa1; | PDBTitle: crystal structure of bacillus thuringiensis cry51aa1 protoxin at 1.652 angstroms resolution |
Added to library: Sat Jun 6 08:16:36 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | I | L | D | L | K | S | L | V | L | N | A | I | N | Y | W | G | P | K | N | N | N | G | I | Q | G | G | D | F | G | Y | P | I | S | E | K | Q | I | D | T | S | I | I | T | S | T | H | P | R | L | I | P | H | D | L | T | I | P | Q | N | L | E | T | I | F | T | T | T | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | N | N | T | D | L | Q | Q | S | Q | T | V | S | F | A | K | K | T | T | T | T | T | S | T | S | T | T | N | G | W | T | E | G | G | K | I | S | D | T | L | E | E | K | V | S | V | S | I | P | F | I | G | E | G | G | G | K | N | S | T | T | I | E | A | N | F | A | H | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | T | T | T | F | Q | Q | A | S | T | D | I | E | W | N | I | S | Q | P | V | L | V | P | P | R | K | Q | V | V | A | T | L | V | I | M | G | G | N | F | T | I | P | M | D | L | M | T | T | I | D | S | T | E | H | Y | S | G | Y | P | I | L | T | W | I | S | S | P | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | Y | N | G | P | F | M | S | W | Y | F | A | N | W | P | N | L | P | S | G | F | G | P | L | N | S | D | N | T | V | T | Y | T | G | S | V | V | S | Q | V | S | A | G | V | Y | A | T | V | R | F | D | Q | Y | D | I | H | N | L | R | T | I | E | K | T | W | Y | A | R | H | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | L | H | N | G | K | K | I | S | I | N | N | V | T | E | M | A | P | T | S | P | I | K | T | N | G | G | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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