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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4phbA_ | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: uncharacterized protein; | PDBTitle: structure of the polysaccharide lyase-like protein cthe_2159 from c.2 thermocellum, gadolinium derivative |
Added to library: Sat Aug 30 08:17:50 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | N | A | K | I | V | F | D | N | D | K | V | N | A | D | N | V | D | G | L | S | V | S | E | R | E | V | K | I | T | K | P | G | M | Y | T | F | S | G | T | W | N | D | G | Q | I | L | V | D | I | G | K | E | F | E | A | V | L | V | L | D | G | V | N | I | T | N | T | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | P | I | Y | I | K | S | A | E | K | V | K | I | E | L | A | D | G | K | D | N | V | L | T | D | A | E | F | Y | E | F | E | D | P | Q | D | N | K | P | N | A | C | I | Y | S | R | D | D | I | T | I | K | G | N | G | N | L | T | V | N | A | N | F | N | N | G | I | G | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | D | L | K | I | T | G | G | N | I | T | V | K | A | F | N | N | G | L | K | G | N | G | S | V | T | I | S | G | G | N | I | D | I | T | A | G | A | D | G | I | K | V | E | N | T | E | E | P | H | K | G | Y | V | N | I | T | G | G | T | I | K | I | R | A | K | D | D | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | D | S | V | R | S | V | S | I | N | N | A | D | V | K | V | S | V | G | G | K | D | V | K | C | E | G | V | L | N | I | A | E | G | C | L | G | K | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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