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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ph0B_ | PDB header: viral protein | Chain: B: PDB Molecule: blv capsid; | PDBTitle: capsid protein from bovine leukemia virus |
Added to library: Sat Jun 13 08:23:28 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | I | I | S | E | N | R | H | R | A | W | A | L | R | E | L | Q | D | I | K | K | E | I | E | N | K | A | P | G | S | Q | V | W | I | Q | T | L | R | L | A | I | L | Q | A | D | P | T | P | A | D | L | E | Q | L | C | Q | Y | I | A | S | P | V | D | Q | T | A | H | M | T | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | T | A | A | I | A | A | A | E | A | A | N | T | L | Q | G | F | N | P | Q | N | G | T | L | T | Q | Q | S | A | Q | P | N | A | G | D | L | R | S | Q | Y | Q | N | L | W | L | Q | A | W | K | N | L | W | S | T | I | V | Q | G | P | A | E | S | Y | V | E | F | V | N | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||
Sequence | Q | I | S | L | A | D | N | L | K | E | P | I | I | D | S | L | S | Y | A | N | A | N | K | E | C | Q | Q | I | L | Q | G | R | G | L | V | A | A | P | V | G | Q | K | L | Q | A | C | A | H | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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