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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pevB_ | PDB header: solute-binding protein | Chain: B: PDB Molecule: membrane lipoprotein family protein; | PDBTitle: crystal structure of abc transporter system solute-binding proteins2 from aeropyrum pernix k1 |
Added to library: Sat May 24 08:25:46 2014 | |
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Sequence | P | I | S | V | L | V | L | F | D | V | G | G | R | G | D | L | S | F | N | D | X | A | A | L | G | A | D | R | A | A | E | E | L | G | V | D | V | V | F | Q | T | P | Q | S | L | A | V | X | E | S | V | L | D | A | A | S | R | S | G | E | Y | D | L | I | V | L | V | G | F | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | Q | E | P | L | E | K | V | A | P | R | Y | P | E | Q | K | Y | A | L | I | D | A | A | T | R | E | R | Y | D | N | V | A | S | Y | L | F | R | E | Q | E | V | A | S | L | V | G | I | I | A | A | D | I | A | N | N | I | S | K | A | T | G | E | E | A | K | A | G | A | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | X | D | I | P | P | L | W | R | F | H | I | G | Y | L | Y | G | V | Q | Y | Y | N | Q | A | X | G | T | D | V | E | X | V | W | T | Y | T | G | R | F | D | D | P | T | L | G | K | T | T | A | E | Q | X | L | Q | Q | G | V | R | V | F | Y | G | V | A | G | L | T | H | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | X | F | N | A | V | K | E | A | A | A | R | G | V | I | A | F | S | I | G | Q | D | A | S | Q | E | W | Y | D | P | Q | T | I | I | I | S | G | L | K | R | V | D | V | A | V | Y | T | A | I | K | D | V | V | E | G | R | F | R | G | G | I | V | S | L | G | L | K | E | G | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | G | L | S | D | E | E | I | I | R | Y | F | A | E | I | A | A | E | T | G | Q | L | P | E | G | L | T | P | E | K | V | V | E | I | V | X | S | Q | R | E | K | W | I | S | N | D | G | W | R | L | V | E | E | L | K | Q | K | I | I | S | G | E | I | K | F | V | T | P | Q | D | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | T | Y | D | S | I | I | E | E | L | K | A | G | N | L | E | A | A | L | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | B |
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