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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pdpB_ | PDB header: transferase | Chain: B: PDB Molecule: serine/threonine-protein kinase rad53; | PDBTitle: crystal structure of rad53 kinase domain and scd2 |
Added to library: Sat May 31 09:44:26 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | G | I | F | K | D | F | S | I | I | D | E | V | V | G | Q | A | T | V | K | K | A | I | E | R | T | T | G | K | T | F | S | V | K | I | I | S | K | D | G | V | T | R | E | L | E | V | L | Q | K | L | N | H | P | R | I | V | R | L | K | G | F | Y | E | D | S | Y | Y | M | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | T | T | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | E | F | V | S | G | G | D | L | M | D | F | V | A | A | H | G | A | V | G | E | D | A | G | R | E | I | S | R | Q | I | L | T | A | I | K | Y | I | H | S | M | G | I | S | H | R | D | L | K | P | D | N | I | L | I | E | Q | D | D | P | V | L | V | K | I | T | A | F | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | V | Q | T | L | A | Y | V | A | P | E | V | I | N | E | Y | S | S | L | V | D | M | W | S | M | G | C | L | V | Y | V | I | L | T | G | H | L | P | F | S | G | S | T | Q | D | Q | L | Y | K | Q | I | G | R | G | S | Y | H | E | G | P | L | K | D | F | R | I | S | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . |
Sequence | A | R | D | F | I | D | S | L | L | Q | V | D | P | N | N | R | S | T | A | A | K | A | L | N | H | P | W | I | K | M | S | P | L | S | Y | G | D | F | S | Q | I | S | L | S | Q | S | L | S | Q | Q | K | L | L | E | N | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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