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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4pdeA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: protein fdhd; | PDBTitle: crystal structure of fdhd in complex with gdp |
Added to library: Sat May 23 08:16:38 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | T | G | V | R | Q | I | E | L | W | R | R | D | D | L | Q | H | P | R | L | D | E | V | A | E | E | V | P | V | A | L | V | Y | N | G | I | S | H | V | V | M | M | A | S | P | K | D | L | E | Y | F | A | L | G | F | S | L | S | E | G | I | I | E | S | P | R | D | I | F | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | D | V | V | P | S | C | N | G | L | E | V | Q | I | E | L | S | S | R | R | F | M | G | L | K | E | R | R | I | G | K | P | V | Q | P | L | P | F | T | Q | T | F | D | L | N | K | L | D | D | A | L | R | H | L | N | D | F | Q | P | V | G | Q | L | T | G | C | T | H | A | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | W | M | L | P | S | G | E | L | V | G | G | H | E | D | V | G | R | H | V | A | L | D | K | L | L | G | R | R | S | Q | E | G | E | S | W | Q | Q | G | A | V | L | V | S | S | R | A | S | Y | E | M | V | Q | K | S | A | M | C | G | V | E | I | L | F | A | V | S | A | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | T | L | A | V | E | V | A | E | R | C | N | L | T | L | V | G | F | C | K | P | G | R | A | T | V | Y | T | H | P | Q | R | L | S | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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