|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4p98A_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: extracellular solute-binding protein; | PDBTitle: abc transporter system solute-bindng protein from conexibacter woesei2 dsm 14684 |
Added to library: Sat Apr 19 23:04:18 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | A | V | V | A | I | I | A | S | G | Q | T | N | D | G | A | F | N | A | W | A | A | E | A | A | E | R | L | K | A | D | G | A | D | V | Q | I | R | Q | G | L | A | D | P | T | Q | A | E | P | V | I | R | Q | F | A | A | R | G | F | D | L | V | V | G | H | G | I | D | V | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | I | L | R | V | A | T | E | F | P | D | V | H | F | S | A | S | G | D | A | T | L | A | E | R | L | P | P | N | V | D | G | W | T | Y | D | F | G | Q | L | G | Y | L | D | G | F | V | A | G | S | L | R | G | V | E | K | V | G | A | V | G | G | P | Q | L | P | F | V | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | G | G | G | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | H | K | G | I | R | A | G | L | K | A | A | N | P | R | A | S | Y | E | E | T | Y | T | G | R | F | Y | D | L | Q | K | E | Q | E | A | A | R | G | L | L | D | K | G | A | Q | L | L | V | A | T | D | D | G | R | G | L | G | Q | A | A | V | A | G | D | V | P | T | I | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | S | A | A | A | G | A | D | I | K | A | V | N | I | T | T | A | L | D | L | L | P | T | Y | Q | S | Y | L | E | Q | I | R | A | G | T | F | G | R | R | F | D | V | L | A | L | G | N | R | G | I | V | L | T | P | I | T | A | V | G | D | V | V | P | D | D | L | Q | A | R | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | L | S | E | R | L | A | S | G | E | L | R | L | P | N | F | F | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|