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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p7nA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: poly-beta-1,6-n-acetyl-d-glucosamine n-deacetylase; | PDBTitle: structure of escherichia coli pgab c-terminal domain in complex with2 glucosamine |
Added to library: Sat Jul 5 08:23:25 2014 | |
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Sequence | G | S | H | M | E | K | S | P | Q | R | I | M | H | I | D | L | D | Y | V | Y | D | E | N | L | Q | Q | M | D | R | N | I | D | V | L | I | Q | R | V | K | D | M | Q | I | S | T | V | Y | L | Q | A | F | A | D | P | D | G | D | G | L | V | K | E | V | W | F | P | N | R | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | B | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | M | K | A | D | I | F | S | R | V | A | W | Q | L | R | T | R | S | G | V | N | I | Y | A | W | M | P | V | L | S | W | D | L | D | P | T | L | T | R | V | K | Y | L | P | T | G | E | K | K | A | Q | I | H | P | E | Q | Y | H | R | L | S | P | F | D | D | R | V | R | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | S | S | S | B | T | T | S | B | B | T | T | S | S | B | T | T | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | G | M | L | Y | E | D | L | A | G | H | A | A | F | D | G | I | L | F | H | D | D | A | L | L | S | D | Y | E | D | A | S | A | P | A | I | T | A | Y | Q | Q | A | G | F | S | G | S | L | S | E | I | R | Q | N | P | E | Q | F | K | Q | W | A | R | F | K | S | R | A | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | F | T | L | E | L | S | A | R | V | K | A | I | R | G | P | H | I | K | T | A | R | N | I | F | A | L | P | V | I | Q | P | E | S | E | A | W | F | A | Q | N | Y | A | D | F | L | K | S | Y | D | W | T | A | I | M | A | M | P | Y | L | E | G | V | A | E | K | S | A | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | W | L | I | Q | L | T | N | Q | I | K | N | I | P | Q | A | K | D | K | S | I | L | E | L | Q | A | Q | N | W | Q | K | N | G | Q | H | Q | A | I | S | S | Q | Q | L | A | H | W | M | S | L | L | Q | L | N | G | V | K | N | Y | G | Y | Y | P | D | N | F | L | H | N | Q | P | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | B | G | G | G | T | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | D | L | I | R | P | E | F | S | T | A | W | Y | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
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