|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4p6qA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: msx2-interacting protein; | PDBTitle: the crystal structure of the split end protein sharp adds a new layer2 of complexity to proteins containing rna recognition motifs |
Added to library: Sat May 17 09:10:35 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | F | G | I | K | V | Q | N | L | P | V | R | S | T | D | T | S | L | K | D | G | L | F | H | E | F | K | K | F | G | K | V | T | S | V | Q | I | H | G | T | S | E | E | R | Y | G | L | V | F | F | R | Q | Q | E | D | Q | E | K | A | L | T | A | S | K | G | K | L | F | F | G | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | I | E | V | T | A | W | I | G | P | E | T | E | S | E | N | E | F | R | P | L | D | E | R | I | D | E | F | H | P | K | A | T | R | T | L | F | I | G | N | L | E | K | T | T | T | Y | H | D | L | R | N | I | F | Q | R | F | G | E | I | V | D | I | D | I | K | K | V | N | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | P | Q | Y | A | F | L | Q | Y | C | D | I | A | S | V | C | K | A | I | K | K | M | D | G | E | Y | L | G | N | N | R | L | K | L | G | F | G | K | S | M | P | T | N | C | V | W | L | D | G | L | S | S | N | V | S | D | Q | Y | L | T | R | H | F | C | R | Y | G | P | V | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | V | V | F | D | R | L | K | G | M | A | L | V | L | Y | N | E | I | E | Y | A | Q | A | A | V | K | E | T | K | G | R | K | I | G | G | N | K | I | K | V | D | F | A | N | R | E | S | Q | L | A | F | Y | H | C | M | E | K | S | G | Q | D | I | R | D | F | Y | E | M | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | R | R | E | E | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|