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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p60B_ | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: calcium-binding mitochondrial carrier protein aralar1; | PDBTitle: structure of the n-terminal domain of the human mitochondrial2 aspartate/glutamate carrier aralar in the apo state |
Added to library: Sat Nov 29 08:23:57 2014 | |
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Sequence | R | N | I | F | L | Q | Y | A | S | T | E | V | D | G | E | R | Y | M | T | P | E | D | F | V | Q | R | Y | L | G | L | Y | N | D | P | N | S | N | P | K | I | V | Q | L | L | A | G | V | A | D | Q | T | K | D | G | L | I | S | Y | Q | E | F | L | A | F | E | S | V | L | C | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | T | S | B | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | D | S | M | F | I | V | A | F | Q | L | F | D | K | S | G | N | G | E | V | T | F | E | N | V | K | E | I | F | G | Q | T | I | I | H | H | H | I | P | F | N | W | D | C | E | F | I | R | L | H | F | G | H | N | R | K | K | H | L | N | Y | T | E | F | T | Q | F | L | Q | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | Q | L | E | H | A | R | Q | A | F | A | L | K | D | K | S | K | S | G | M | I | S | G | L | D | F | S | D | I | M | V | T | I | R | S | H | M | L | T | P | F | V | E | E | N | L | V | S | A | A | G | G | S | I | S | H | Q | V | S | F | S | Y | F | N | A | F | N | S | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | N | M | E | L | V | R | K | I | Y | S | T | L | V | T | K | E | E | F | A | Q | S | A | I | R | Y | G | Q | V | T | P | L | E | I | D | I | L | Y | Q | L | A | D | L | Y | N | A | S | G | R | L | T | L | A | D | I | E | R | I | A | P | L | A | E | G | A | L | P | Y | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | B |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | E | L | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
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