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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p5wA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: calcium-binding mitochondrial carrier protein aralar2, | PDBTitle: structure of the n- and c-terminal domain fusion of the human2 mitochondrial aspartate/glutamate carrier citrin in the calcium-bound3 state |
Added to library: Sat Nov 29 08:21:49 2014 | |
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Sequence | T | K | R | A | D | P | A | E | L | R | T | I | F | L | K | Y | A | S | I | E | K | N | G | E | F | F | M | S | P | N | D | F | V | T | R | Y | L | N | I | F | S | Q | P | N | P | K | T | V | E | L | L | S | G | V | V | D | Q | T | K | D | G | L | I | S | F | Q | E | F | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | E | S | V | L | C | A | P | D | A | L | F | M | V | A | F | Q | L | F | D | K | A | G | K | G | E | V | T | F | E | D | V | K | Q | V | F | G | Q | T | T | I | H | Q | H | I | P | F | N | W | D | S | E | F | V | Q | L | H | F | G | K | E | R | K | R | H | L | T | Y | A | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | B | S | S | T | T | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | T | Q | F | L | L | E | I | Q | L | E | H | A | K | Q | A | F | V | Q | R | D | N | A | R | T | G | R | V | T | A | I | D | F | R | D | I | M | V | T | I | R | P | H | V | L | T | P | F | V | E | E | C | L | V | A | A | A | G | G | T | T | S | H | Q | V | S | F | S | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | G | F | N | S | L | L | N | N | M | E | L | I | R | K | I | Y | S | T | L | A | G | T | R | K | D | V | E | V | T | K | E | E | F | V | L | A | A | Q | K | F | G | Q | V | T | P | M | E | V | D | I | L | F | Q | L | A | D | L | Y | E | P | R | G | R | M | T | L | A | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | R | I | A | P | P | N | P | D | H | V | G | G | Y | K | L | A | V | A | T | F | A | G | I | E | N | K | F | G | L | Y | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G |
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