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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p3fA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: signal recognition particle subunit srp68; | PDBTitle: structure of the human srp68-rbd |
Added to library: Sat Apr 19 22:53:52 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | S | L | S | L | E | I | L | Q | I | I | K | E | S | Q | Q | Q | H | G | L | R | H | G | D | F | Q | R | Y | R | G | Y | C | S | R | R | Q | R | R | L | R | K | T | L | N | F | K | M | G | N | R | H | K | F | T | G | K | K | V | T | E | D | L | L | T | D | N | R | Y | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | V | L | M | D | A | E | R | A | W | S | Y | A | M | Q | L | K | Q | E | A | R | K | R | F | H | L | L | S | R | L | R | K | A | V | K | H | A | E | E | L | E | R | L | C | E | S | N | R | V | D | A | K | T | K | L | E | A | Q | A | Y | T | A | Y | L | S | G | M | L | R | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | ||||||||||
Sequence | E | H | Q | E | W | K | A | A | I | E | A | F | N | K | C | K | T | I | Y | E | K | L | A | S | A | F | T | E | E | Q | A | V | L | Y | N | Q | R | V | E | E | I | S | P | N | I | R | Y | C | A | Y | N | I | G | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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