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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p29A_ | PDB header: protein binding | Chain: A: PDB Molecule: lpoa; | PDBTitle: crystal structure of the lpoa n-terminal domain from haemophilus2 influenzae |
Added to library: Sat Mar 7 08:20:37 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | F | T | Q | T | L | Q | K | D | A | N | A | S | S | E | F | Y | I | N | K | L | G | Q | T | Q | E | L | E | D | Q | Q | T | Y | K | L | L | A | A | R | V | L | I | R | E | N | K | V | E | Q | S | A | A | L | L | R | E | L | G | E | L | N | D | A | Q | K | L | D | R | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | S | S | T | G | G | G | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | E | A | R | I | S | A | A | K | N | A | N | E | V | A | Q | N | Q | L | R | A | L | D | L | N | K | L | S | P | S | Q | K | S | R | Y | Y | E | T | L | A | I | V | A | E | N | R | K | D | X | I | E | A | V | K | A | R | I | E | X | D | K | N | L | T | D | V | Q | R | H | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | N | I | D | K | T | W | A | L | L | R | S | A | N | T | G | V | I | N | N | A | S | D | E | G | N | A | A | L | G | G | W | L | T | L | I | K | A | Y | N | D | Y | I | R | Q | P | V | Q | L | S | Q | A | L | Q | S | W | K | N | A | Y | P | N | H | A | A | A | T | L | F | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | E | L | L | T | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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