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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4p27A_ | PDB header: allergen | Chain: A: PDB Molecule: venom allergen-like (val) 4 protein; | PDBTitle: structure of schistosoma mansoni venom allergen-like protein 42 (smval4) |
Added to library: Sat Aug 9 08:31:45 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | S | E | G | Q | R | A | I | Y | N | F | H | K | K | V | R | K | D | V | K | N | C | R | I | P | G | Q | P | P | A | K | N | L | T | K | L | K | W | N | K | L | L | A | N | K | A | K | Q | Q | A | K | R | C | K | Y | D | S | N | D | P | N | D | F | I | I | G | D | F | E | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | B | S | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | G | Q | N | L | A | D | Y | P | T | I | E | G | A | M | K | D | W | L | E | E | Y | K | N | Y | N | F | E | K | N | Q | C | N | G | D | C | K | N | Y | K | Q | M | V | W | N | T | T | E | E | I | G | C | G | Y | E | K | C | G | K | N | Y | L | I | V | C | N | Y | A | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | D | S | E | D | R | P | Y | E | A | K | P | E | S | K | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | B | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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