|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4oonA_ | PDB header: transferase/transferase inhibitor | Chain: A: PDB Molecule: penicillin-binding protein 1a; | PDBTitle: crystal structure of pbp1a in complex with compound 17 ((4z,8s,11e,2 14s)-5-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-14-(5,6-dihydroxy-1,3-dioxo-1,3-3 dihydro-2h-isoindol-2-yl)-8-formyl-2-methyl-6-oxo-3,10-dioxa-4,7,11-4 triazatetradeca-4,11-diene-2,12,14-tricarboxylic acid) |
Added to library: Sat May 10 08:41:26 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | L | K | V | Y | S | E | D | G | K | L | I | S | E | F | G | E | M | T | P | E | L | N | A | P | Y | I | A | E | M | A | R | A | E | M | V | G | R | Y | G | S | E | A | Y | T | E | G | Y | K | V | I | T | T | V | R | S | D | L | Q | N | A | A | S | Q | S | V | R | D | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | D | Y | D | Q | R | H | G | Y | R | G | P | E | T | R | L | P | G | Q | T | R | D | A | W | L | K | H | L | G | Q | Q | R | S | I | G | G | L | E | P | A | I | V | T | Q | V | E | K | S | G | I | M | V | M | T | R | D | G | K | E | E | A | V | T | W | D | S | M | K | W | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | T | T | T | B | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | P | F | L | S | N | N | S | M | G | P | M | P | R | Q | P | A | D | V | A | Q | A | G | D | Q | I | R | V | Q | R | Q | E | D | G | T | L | R | F | V | Q | I | P | A | A | Q | S | A | L | I | S | L | D | P | K | D | G | A | I | R | S | L | V | G | G | F | S | F | E | Q | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | S | B | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | B | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | Y | N | R | A | I | Q | A | K | R | Q | P | G | S | S | F | K | P | F | I | Y | S | A | A | L | D | N | G | F | T | A | A | S | L | V | N | D | A | P | I | V | F | V | D | E | Y | L | T | F | L | G | P | I | P | L | R | E | A | L | Y | K | S | R | N | M | V | S | I | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | G | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | L | Q | G | L | G | I | E | R | A | I | S | Y | I | T | K | F | G | F | Q | R | D | E | L | P | R | N | F | S | L | A | L | G | T | A | T | V | T | P | M | E | I | A | G | A | W | S | V | F | A | N | G | G | Y | K | V | N | P | Y | V | I | E | R | I | E | S | R | D | G | Q | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | S | S | S | G | G | G | G | G | T | B | T | T | S | B | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 370 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 380 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 390 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 400 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 410 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 420 |
Sequence | L | Y | Q | A | N | P | P | R | V | P | V | E | P | T | P | A | E | R | I | I | D | A | R | T | A | Y | I | M | T | S | M | L | Q | D | V | I | K | R | G | T | G | R | R | A | L | A | L | K | R | T | D | L | A | G | K | T | G | T | T | N | D | S | K | D | G | W | F | S | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | B | S | T | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 430 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 440 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 450 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 460 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 470 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 480 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 490 |
Sequence | N | S | D | Y | V | T | S | V | W | V | G | F | D | Q | P | E | T | L | G | R | R | E | Y | G | G | T | V | A | L | P | I | W | I | R | Y | M | G | F | A | L | K | D | K | P | M | H | T | M | A | E | P | P | G | I | V | S | L | R | I | D | P | V | T | G | R | S | A | A | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 500 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | P | G | A | Y | F | E | M | F | K | N | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|