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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4oogC_ | PDB header: hydrolase/rna | Chain: C: PDB Molecule: ribonuclease 3; | PDBTitle: crystal structure of yeast rnase iii (rnt1p) complexed with the2 product of dsrna processing |
Added to library: Sat Apr 19 23:02:33 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | W | P | P | K | L | P | E | I | Q | D | L | A | I | R | A | R | V | F | I | H | K | S | T | I | K | D | K | V | Y | L | S | G | S | E | M | I | N | A | H | N | E | R | L | E | F | L | G | D | S | I | L | N | S | V | M | T | L | I | I | Y | N | K | F | P | D | Y | S | E | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | S | T | L | R | M | N | L | V | S | N | E | Q | I | K | Q | W | S | I | M | Y | N | F | H | E | K | L | K | T | N | F | D | L | K | D | E | N | S | N | F | Q | N | G | K | L | K | L | Y | A | D | V | F | E | A | Y | I | G | G | L | M | E | D | D | P | R | N | N | L | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | I | R | K | W | L | R | K | L | A | K | P | V | I | E | E | A | T | R | N | Q | V | A | L | E | K | T | D | K | L | D | M | N | A | K | R | Q | L | Y | S | L | I | G | Y | A | S | L | R | L | H | Y | V | T | V | K | K | P | T | A | V | D | P | N | S | I | V | E | C | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | |||
Sequence | G | D | G | T | V | L | G | T | G | V | G | R | N | I | K | I | A | G | I | R | A | A | E | N | A | L | R | D | K | K | M | L | D | F | Y | A | K | Q | R | A | A | I | P | R | S | E | S | V | L | K | D | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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