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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ohnA_ | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: abc transporter substrate-binding protein; | PDBTitle: crystal structure of an abc uptake transporter substrate binding2 protein from streptococcus pneumoniae with bound histidine |
Added to library: Sat Jan 24 09:45:35 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | S | G | D | N | W | S | K | Y | Q | S | N | K | S | I | T | I | G | F | D | S | T | F | V | P | M | G | F | A | Q | K | D | G | S | Y | A | G | F | D | I | D | L | A | T | A | V | F | E | K | Y | G | I | T | V | N | W | Q | P | I | D | W | D | L | K | E | A | E | L | T | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | T | I | D | L | I | W | N | G | Y | S | A | T | D | E | R | R | E | K | V | A | F | S | N | S | Y | M | K | N | E | Q | V | L | V | T | K | K | S | S | G | I | T | T | A | K | D | M | T | G | K | T | L | G | A | Q | A | G | S | S | G | Y | A | D | F | E | A | N | P | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | B | T | T | G | G | G | T | S | G | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | N | I | V | A | N | K | E | A | N | Q | Y | Q | T | F | N | E | A | L | I | D | L | K | N | D | R | I | D | G | L | L | I | D | R | V | Y | A | N | Y | Y | L | E | A | E | G | V | L | N | D | Y | N | V | F | T | V | G | L | E | T | E | A | F | A | V | G | S | R | K | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | D | T | T | L | V | K | K | I | N | E | A | F | S | S | L | Y | K | D | G | K | F | Q | E | I | S | Q | K | W | F | G | E | D | V | A | T | K | H | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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