|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c4ofqA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: putative cell surface protein; | PDBTitle: structure of the c-terminal domain of the streptococcus pyogenes2 antigen i/ii-family protein aspa |
Added to library: Sat Mar 15 08:14:55 2014 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | D | N | L | I | Q | P | T | K | T | I | V | D | D | K | G | Q | S | I | D | G | K | S | V | L | P | N | S | T | L | T | Y | V | A | K | Q | D | F | D | Q | Y | K | G | M | T | A | A | K | E | S | V | M | K | G | F | I | Y | V | D | D | Y | K | D | E | A | I | D | G | H | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | T | T | S | B | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | V | V | N | S | I | K | A | A | N | G | D | D | V | T | N | L | L | E | M | R | H | V | L | S | Q | D | T | L | D | D | K | L | K | A | L | I | K | A | S | G | I | S | P | V | G | E | F | Y | M | W | V | A | K | D | P | A | A | F | Y | K | A | Y | V | Q | K | G | L | D | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | Y | N | L | S | F | K | L | K | Q | D | F | K | K | G | D | I | T | N | Q | T | Y | Q | I | D | F | G | N | G | Y | Y | G | N | I | V | V | N | H | L | S | E | L | T | V | H | K | D | V | F | D | K | E | G | G | Q | S | I | N | A | G | T | V | K | V | G | D | E | V | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | L | E | G | W | V | V | P | T | N | R | G | Y | D | L | T | E | Y | K | F | V | D | Q | L | Q | H | T | H | D | L | Y | Q | K | D | K | V | L | A | T | V | D | I | T | L | S | D | G | S | V | I | T | K | G | T | D | L | A | K | Y | T | E | T | V | Y | N | K | E | T | G | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | B | S | S | T | T | T | S | S | B | T | T | S | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Y | E | L | A | F | K | Q | D | F | L | A | K | V | V | R | S | S | E | F | G | A | D | A | F | V | V | V | K | R | I | K | A | G | D | V | A | N | E | Y | T | L | Y | V | N | G | N | P | V | K | S | N | K | V | T | T | H | T | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | B | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|