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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ofpC_ | PDB header: cell adhesion | Chain: C: PDB Molecule: protein syg-2; | PDBTitle: crystal structure of syg-2 d3-d4 |
Added to library: Sat Feb 22 09:04:59 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | P | T | V | E | I | L | R | N | P | S | A | L | R | S | G | D | N | V | T | I | A | C | S | V | T | G | G | N | P | P | P | D | V | F | W | Y | H | E | N | K | R | L | Q | S | H | S | T | L | D | T | R | S | K | E | I | K | N | I | Y | S | F | I | A | S | Q | N | D | N | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | E | Y | E | C | R | A | N | N | S | R | P | K | R | K | A | M | K | L | E | V | N | Y | P | P | A | S | V | E | L | F | G | E | S | N | I | R | Y | G | S | S | A | N | I | Q | C | K | S | L | P | S | N | P | A | S | Q | I | T | W | I | I | N | G | R | S | V | P | T | P | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | B | B | S | S | T | T | B | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | |||
Sequence | Q | R | E | F | V | V | E | N | G | I | V | S | S | S | N | V | S | V | H | S | N | E | L | S | V | E | A | H | Q | I | N | V | E | C | M | A | T | N | P | E | G | S | S | A | K | Q | H | V | I | K | I | I | A | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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