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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ofdB_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: kin of irre-like protein 1; | PDBTitle: crystal structure of mouse neph1 d1-d2 |
Added to library: Sat Feb 22 09:28:51 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | Q | T | R | F | S | Q | E | P | A | D | Q | T | V | V | A | G | Q | R | A | V | L | P | C | V | L | L | N | Y | S | G | I | V | Q | W | T | K | D | G | L | A | L | G | M | G | Q | G | L | K | A | W | P | R | Y | R | V | V | G | S | A | D | A | G | Q | Y | N | L | E | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | B | S | S | S | B | S | S | B | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | A | E | L | S | D | D | A | S | Y | E | C | Q | A | T | E | A | A | L | R | S | R | R | A | K | L | T | V | L | I | P | P | E | E | T | R | I | D | G | G | P | V | I | L | L | P | Y | N | L | T | C | R | A | F | N | A | K | P | A | A | T | I | I | W | F | R | D | G | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | B | S | S | S | B | S | T | T | S | S | B | B | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | Q | E | G | A | V | T | S | T | E | L | L | K | D | G | K | R | E | T | T | I | S | Q | L | L | I | E | P | T | D | L | D | I | G | R | V | F | T | C | R | S | M | N | E | A | I | P | N | G | K | E | T | S | I | E | L | D | V | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | S | S | S | B | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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