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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4o9iX_ | PDB header: hydrolase | Chain: X: PDB Molecule: chromodomain-helicase-dna-binding protein 4; | PDBTitle: structure of chd4 double chromodomains depicts cooperative folding for2 dna binding |
Added to library: Sat Jul 11 08:20:45 2015 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | L | Y | F | Q | X | K | G | K | V | Q | K | I | L | I | W | K | W | G | Q | P | P | S | P | T | P | V | P | R | P | P | D | A | D | P | P | K | P | L | E | G | R | P | E | R | Q | F | F | V | K | W | Q | G | X | S | Y | W | H | C | S | W | V | S | E | L | Q | L | E | L | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | Q | V | X | F | R | N | Y | Q | R | K | N | D | X | D | E | P | P | S | D | E | E | K | S | R | K | R | K | N | K | D | P | K | F | A | E | X | E | E | R | F | Y | R | Y | G | I | K | P | E | W | X | X | I | H | R | I | L | N | H | S | V | D | K | K | G | H | V | H | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | G | G | G | T | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | I | K | W | R | D | L | P | Y | D | Q | A | S | W | E | S | E | D | V | E | I | Q | D | Y | D | L | F | K | Q | S | Y | W | N | H | R | E | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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