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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4o88A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: n-tagged nuclease; | PDBTitle: crystal structure of a c-tagged nuclease |
Added to library: Sat Oct 18 10:37:09 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | T | T | C | L | N | E | G | A | I | G | Y | M | A | I | D | I | L | Q | S | Q | N | I | E | T | I | T | I | N | D | N | E | Y | K | L | N | K | F | N | N | I | K | D | Y | I | S | K | V | W | G | A | A | S | V | Y | N | L | D | L | G | N | D | Y | T | K | W | Q | S | S | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | B | S | S | B | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | N | V | E | T | D | N | I | K | N | Y | I | N | G | H | D | N | V | Y | Y | N | P | G | G | K | N | K | Y | L | I | I | E | A | S | K | E | L | K | W | K | G | N | L | N | N | N | K | F | N | V | N | L | K | S | I | F | S | N | A | E | N | L | K | V | G | H | S | D | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | G | G | G | G | G | G | G | B | G | G | G | G | B | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | L | F | S | S | I | V | N | S | K | G | S | D | N | Q | K | K | V | L | N | S | L | L | D | N | I | N | D | R | R | L | K | K | L | V | S | T | G | Q | W | T | E | A | I | S | D | S | V | A | N | E | I | A | K | N | N | K | L | T | S | I | K | A | Q | L | G | S | Q | K | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | B | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | N | V | M | I | D | A | N | G | H | D | L | L | K | I | D | Y | D | K | T | F | V | T | A | N | D | L | K | N | K | I | I | D | K | N | K | L | E | N | A | K | N | Y | F | K | I | Q | N | N | D | K | I | L | E | D | I | K | S | K | F | S | K | N | I | N | E | N | I | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | S | B | T | S | B | S | T | T | T | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||
Sequence | S | I | R | D | H | A | K | L | I | E | F | T | E | N | K | K | F | N | T | I | N | D | N | S | N | S | D | S | K | I | K | S | I | T | C | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S |
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