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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4o6bA_ | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: non-structural protein 1; | PDBTitle: dengue type2 virus non-structural protein 1 (ns1) form 1 crystal |
Added to library: Sat Feb 22 08:12:57 2014 | |
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Sequence | A | D | S | G | C | V | V | S | K | E | L | K | C | G | S | G | I | F | I | T | D | N | V | H | T | W | T | E | Q | Y | K | F | Q | P | E | S | P | S | K | L | A | S | A | I | Q | K | A | H | E | E | G | I | C | G | I | R | S | V | T | R | L | E | N | L | M | W | K | Q | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | E | L | N | H | I | L | S | E | N | E | V | K | L | T | I | M | T | G | D | I | K | G | I | M | Q | A | G | K | R | S | L | R | P | Q | H | N | Q | T | F | L | I | D | G | P | E | T | A | E | C | P | N | T | N | R | A | W | N | S | L | E | V | E | D | Y | N | I | W | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | E | K | Q | D | V | F | C | D | S | K | L | M | S | A | A | I | K | D | N | R | A | V | H | A | D | M | G | Y | W | I | E | S | A | L | N | D | T | W | K | I | E | K | A | S | F | I | E | V | K | N | C | H | W | P | K | S | H | T | L | W | S | N | G | V | L | E | S | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | M | I | I | P | K | N | L | A | G | P | V | S | Q | H | N | Y | R | P | G | Y | H | T | Q | I | T | G | P | W | H | L | G | K | L | E | M | D | F | D | F | C | D | G | T | T | V | V | V | T | E | D | C | G | N | R | G | P | S | L | R | T | T | T | A | S | G | K | L | I | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | W | C | C | R | S | C | T | L | P | P | L | R | Y | R | G | E | D | G | C | W | Y | G | M | E | I | R | P | L | K | E | K | E | E | N | L | V | N | S | L | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | S | B |
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