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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4o2zA_ | PDB header: transferase | Chain: A: PDB Molecule: mitogen-activated protein kinase 3, putative; | PDBTitle: crystal structure of mpk3 from leishmania donovani, ldbpk_100540 in2 the presence of nvp-bbt594 |
Added to library: Sat Jan 25 09:31:19 2014 | |
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Sequence | N | L | Y | F | Q | G | N | Q | E | L | S | V | P | K | I | V | G | D | F | K | V | Y | N | V | S | G | S | P | F | E | V | P | S | K | Y | T | L | L | K | I | L | G | M | G | A | Y | G | I | A | C | S | C | L | D | G | D | T | G | E | K | V | S | I | K | K | C | R | D | V | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | D | V | E | D | G | K | R | V | L | R | E | I | D | M | M | R | F | F | H | H | E | N | L | L | N | V | V | N | I | L | P | P | L | K | R | E | Y | H | S | F | E | D | V | Y | V | V | T | P | L | M | D | V | D | M | N | V | V | L | R | S | R | Q | V | L | E | E | S | H | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | B | S | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | Y | F | V | Y | Q | I | L | R | G | L | K | Y | L | H | S | A | N | V | A | H | R | D | L | K | P | A | N | L | V | T | N | I | S | C | E | L | K | I | I | D | F | G | L | S | R | S | V | P | Y | S | E | L | T | D | Y | V | I | T | R | W | Y | R | P | P | E | L | L | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | B | G | G | G | G | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | T | N | Y | S | T | A | V | D | I | W | S | V | G | C | I | F | A | E | M | Y | N | R | K | P | V | F | P | G | R | N | T | M | D | Q | L | R | M | I | A | Q | H | I | G | K | P | P | A | S | I | V | E | H | R | E | A | L | E | K | L | N | E | L | P | D | G | S | L | N | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S | T | S | T | T | S | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | P | K | L | V | P | G | L | A | G | N | T | E | G | I | D | F | L | S | K | M | W | T | L | D | P | S | K | R | P | T | A | A | D | M | L | A | H | P | Y | L | A | H | L | H | D | E | E | D | E | P | T | C | P | C | P | F | L | W | A | H | E | S | T | P | M | G | V | S | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | T | S | T | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | R | A | F | W | A | D | I | V | D | Y | N | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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