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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nwwC_ | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: capsid protein; | PDBTitle: crystal structure of an n-terminally truncated capsid protein mutant2 of orsay virus |
Added to library: Sat Aug 23 08:14:25 2014 | |
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Sequence | S | N | S | I | L | L | K | G | C | D | R | I | V | T | V | V | D | A | S | T | Y | D | A | G | S | A | I | V | S | I | P | I | T | P | D | I | A | Y | R | L | G | S | T | A | R | T | F | Q | R | I | K | Y | R | S | L | K | F | R | V | N | A | Q | C | A | T | T | T | A | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | V | A | G | F | V | K | D | A | A | D | V | L | P | T | G | T | A | S | I | P | Y | L | M | S | N | T | G | S | F | T | Q | P | W | W | K | S | T | V | H | N | V | K | I | P | Q | K | L | F | Y | T | E | A | P | T | R | G | A | D | A | V | R | E | Y | C | P | G | Q | F | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | L | V | D | S | K | P | S | Q | I | C | P | V | T | V | D | L | E | W | V | V | E | L | H | D | A | T | F | R | K | E | S | D | Q | T | A | I | S | A | I | V | A | D | H | T | L | N | V | Y | G | L | P | A | T | S | N | R | V | G | H | I | L | I | S | P | I | G | Q | T | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | D | L | T | P | T | R | F | A | T | F | F | G | F | L | P | D | D | K | F | C | V | R | I | P | T | P | V | D | V | V | L | T | G | D | N | V | Y | Q | S | V | E | A | T | H | I | R | A | Y | L | V | N | G | G | L | G | I | D | F | H | L | A | A | Y | N | D | T | T | H | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . |
Sequence | I | Q | P | I | I | P | T | L | W | N | V | Y | D | V | T | G | A | V | T | A | P | F | T | S | A | I | Y | D | N | H | V | W | T | H | K | D | K | F | V | P | V | S | F | Q | D | E | P | I | P | G | T | V | F | D | Y | L | Y | P | R | S | Y | S | L | P | S | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | T | T | S | B | T | T | B | T | T | T | S | S |
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