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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nu3A_ | PDB header: antifreeze protein | Chain: A: PDB Molecule: ice-binding protein; | PDBTitle: crystal structure of mffibp, a capping head region swapped mutant of2 ice-binding protein |
Added to library: Sat Apr 19 22:52:23 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | G | Q | T | L | D | L | V | N | L | G | V | A | A | N | F | A | I | L | S | K | T | G | I | T | D | V | Y | K | S | A | I | T | G | D | I | G | V | S | P | A | A | A | T | Y | I | T | G | F | G | L | T | Q | D | S | S | T | T | Y | A | T | S | P | Q | V | T | G | L | I | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S | B | S | S | S | S | B | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | D | Y | S | T | P | T | P | S | R | L | T | T | A | V | G | D | M | Q | I | A | Y | D | N | A | A | G | R | L | N | P | D | F | L | N | L | G | A | G | T | I | G | G | K | T | L | T | P | G | L | Y | K | W | T | S | T | L | N | I | P | T | D | I | T | I | S | G | S | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | B | T | T | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | D | V | W | I | F | Q | V | A | G | N | L | N | M | S | S | A | V | R | I | T | L | A | G | G | A | Q | A | K | N | I | F | W | Q | T | A | G | A | V | T | L | G | S | T | S | H | F | E | G | N | I | L | S | Q | T | G | I | N | M | K | T | A | A | S | I | N | G | R | M | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | B | T | T | G | G | G | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | Q | T | A | V | T | L | Q | M | N | T | V | T | I | P | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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