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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4ntjA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: p2y purinoceptor 12, soluble cytochrome b562; | PDBTitle: structure of the human p2y12 receptor in complex with an2 antithrombotic drug |
Added to library: Sat Mar 29 09:12:51 2014 | |
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Sequence | L | C | T | R | D | Y | K | I | T | Q | V | L | F | P | L | L | Y | T | V | L | F | F | V | G | L | I | T | N | G | L | A | M | R | I | F | F | Q | I | R | S | K | S | N | F | I | I | F | L | K | N | T | V | I | S | D | L | L | M | I | L | T | F | P | F | K | I | L | S | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | L | L | R | T | F | V | C | Q | V | T | S | V | I | F | Y | F | T | M | Y | I | S | I | S | F | L | G | L | I | T | I | D | R | Y | Q | K | T | T | R | P | F | K | T | K | N | L | L | G | A | K | I | L | S | V | V | I | W | A | F | M | F | L | L | S | L | P | N | M | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | S | E | F | G | L | V | W | H | E | I | V | N | Y | I | C | Q | V | I | F | W | I | N | F | L | I | V | I | V | C | Y | T | L | I | T | K | E | L | Y | R | S | Y | V | R | T | A | D | L | E | D | N | W | E | T | L | N | D | N | L | K | V | I | E | K | A | D | N | A | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | K | D | A | L | T | K | M | R | A | A | A | L | D | A | Q | K | A | T | P | P | K | L | E | D | F | R | H | G | F | D | I | L | V | G | Q | I | D | D | A | L | K | L | A | N | E | G | K | V | K | E | A | Q | A | A | A | E | Q | L | K | T | T | R | N | A | Y | I | Q | K | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | L | R | G | V | G | K | V | R | K | K | V | N | V | K | V | F | I | I | I | A | V | F | F | I | C | F | V | P | F | H | F | A | R | I | P | Y | T | L | S | Q | T | R | D | V | F | D | C | T | A | E | N | T | L | F | Y | V | K | E | S | T | L | W | L | T | S | L | N | A | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | P | F | I | Y | F | F | L | C | K | S | F | R | N | S | L | I | S | M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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