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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c4nstA_ | PDB header: transferase/transcription | Chain: A: PDB Molecule: cyclin-dependent kinase 12; | PDBTitle: crystal structure of human cdk12/cyclin k in complex with adp-aluminum2 fluoride |
Added to library: Sat Mar 29 09:29:52 2014 | |
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Sequence | E | S | D | W | G | K | R | C | V | D | K | F | D | I | I | G | I | I | G | E | G | T | Y | G | Q | V | Y | K | A | K | D | K | D | T | G | E | L | V | A | L | K | K | V | R | L | D | N | E | K | E | G | F | P | I | T | A | I | R | E | I | K | I | L | R | Q | L | I | H | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | V | N | M | K | E | I | V | T | D | K | Q | D | G | A | F | Y | L | V | F | E | Y | M | D | H | D | L | M | G | L | L | E | S | G | L | V | H | F | S | E | D | H | I | K | S | F | M | K | Q | L | M | E | G | L | E | Y | C | H | K | K | N | F | L | H | R | D | I | K | C | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | T | T | T | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | I | L | L | N | N | S | G | Q | I | K | L | A | D | F | G | L | A | R | L | Y | N | S | E | E | S | R | P | Y | N | K | V | I | T | L | W | Y | R | P | P | E | L | L | L | G | E | E | R | Y | T | P | A | I | D | V | W | S | C | G | C | I | L | G | E | L | F | T | K | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | T | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | F | Q | A | N | L | E | L | A | Q | L | E | L | I | S | R | L | C | G | S | P | C | P | A | V | W | P | D | V | I | K | L | P | Y | F | N | T | M | K | P | K | K | Q | Y | R | R | R | L | R | E | E | F | S | F | I | P | S | A | A | L | D | L | L | D | H | M | L | T | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . |
Sequence | P | S | K | R | C | T | A | E | Q | T | L | Q | S | D | F | L | K | D | V | E | L | S | K | M | A | P | P | D | L | P | H | W | Q | D | C | H | E | L | W | S | K | K | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | G | G | G | S | S | S |
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